Diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la microarray
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- Benjamín Urrutia
La secuenciación de ADN es la determinación de la disposición de los bloques de construcción químicos llamadas "nucleobases" en toda la cadena de molécula de ADN. Esta decodificación de secuencias genéticas muestra a los científicos la información genética codificada en un segmento de ADN dado. En la doble hélice de ADN, cada una de las bases químicas siempre se une de la misma manera, para formar "pares de bases.La adenina (a) siempre se une a la timina (t), y la citosina (c) siempre se une a la guanina (g). Este emparejamiento subyace al mecanismo por el cual se copian las moléculas de ADN durante la división celular. El emparejamiento es la base de los métodos utilizados para la secuenciación de ADN. Existen diferentes técnicas de secuenciación, utilizadas para diferentes propósitos.
La capacidad del ADN para codificar la información genética es enorme: el número posible de configuraciones de una cadena de ADN que consiste en n nucleótidos es 4n. Dependiendo de los propósitos del análisis, puede ser necesario revelar todo el genoma de un individuo o solo identificar si ciertos genes están presentes. El proceso por el cual se determina la secuencia de ADN completa de un genoma se llama secuenciación del genoma completo. El proceso de detección de la expresión génica de ciertos genes predefinidos utilizando portaobjetos de microscopio con ciertas secuencias de ADN o genes ubicados en posiciones definidas se llama microarray.
¿Qué es la secuenciación del genoma completo??
La secuenciación completa del genoma es el proceso por el cual la secuencia de ADN completa del genoma humano, animal, planta, bacteriano o viral se determina simultáneamente. A través de la secuenciación del genoma completo, se lee toda la información hereditaria de un organismo vivo. El resultado es una lista con la secuencia de nucleótidos crudos del conjunto de cromosomas haploideos. La secuenciación completa del genoma es una herramienta poderosa para diagnosticar enfermedades genéticas raras. Sin embargo, para comprender el significado médico o biológico de la información obtenida, es necesario un análisis adicional.
En 2003, el genoma humano fue completamente descifrado por primera vez en un programa de investigación internacional lanzado en 1990 llamado Proyecto del Genoma Humano (HGP). El genoma humano contiene aproximadamente 3 mil millones de pares de bases y es el conjunto completo de "instrucciones" de codificación para la creación y reproducción de cada organismo. La secuenciación completa del genoma genera una gran cantidad de datos y necesita capacidad de almacenamiento relevante y energía informática.
Que es microarray?
Microarray es tecnología de laboratorio para la detección de la expresión génica, una biblioteca peculiar de muestras de ácido nucleico sintético inmovilizado, dispuesto espacialmente en una base sólida. Utiliza un portaobjetos de microscopio con ciertas secuencias de ADN o genes ubicados en posiciones definidas. El uso de la hibridación para secuencias complementarias, esta tecnología ayuda a perfilar y estudiar simultáneamente el transcriptoma (i.mi. El conjunto de todas las moléculas de ARN expresadas en una célula).
La tecnología de microarrays de ADN se desarrolló a mediados de la década de 1990. La base de esta tecnología es la hibridación entre el reverso de ADNc transcrito de una muestra celular a un portaobjetos con una sonda de ADN complementaria conectada.
Inicialmente, los microarrays consistieron en papel de filtro con ADNc inmovilizados. Desde 1995 consisten en sondas sintéticas cortas unidas en puntos específicamente designados en la base sólida (silicio o vidrio).
Los microarrays de ADN se usan en el diagnóstico de la enfermedad para la detección de ciertos genes relevantes para la enfermedad o sus biomarcadores. También se utilizan para el análisis de mutaciones, la detección de anomalías cromosómicas, detección de polimorfismos de un solo nucleótido y determinación de la modificación postraduccional.
El principio principal detrás de este método es la capacidad de las secuencias de ADN para emparejarse con las complementarias a través de enlaces de hidrógeno. La gran cantidad de pares de bases complementarias asegura un fuerte vínculo. Las secuencias unidas no específicamente se eliminan mientras que las fuertemente unidas permanecen unidas al microarray.
Diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la microarray
Definición
Secuenciación completa del genoma: La secuenciación del genoma completo es un proceso de determinación de la secuencia de ADN completa del genoma humano, animal, vegetal, bacteriano o viral.
Microarray: El proceso de detección de la expresión génica de genes predefinidos utilizando portaobjetos de microscopio con ciertas secuencias de ADN o genes ubicados en posiciones definidas se llama microarray.
Principio
Secuenciación completa del genoma: La secuenciación del genoma completo es una técnica basada en secuenciación.
Microarray: Microarray es una técnica basada en hibridación.
Resultados
Secuenciación completa del genoma: La secuenciación de WholeGenome identifica todas las secuencias en un genoma.
Microarray: Microarray identifica la presencia de secuencias predefinidas.
Precio
Secuenciación completa del genoma: La secuenciación completa del genoma es más costosa en comparación con las microarrays.
Microarray: La microarray es más barata que la secuenciación del genoma completo.
Poder computacional
Secuenciación completa del genoma: La secuenciación completa del genoma genera una gran cantidad de datos y necesita capacidad de almacenamiento relevante y energía informática.
Microarray: Microarray define la presencia/ausencia de secuencias predefinidas y no requiere una capacidad de almacenamiento significativa y potencia informática.
Diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la microarray
Resumen:
- Cada molécula de ADN es un cromosoma separado envasado, y toda la información genética contenida en el conjunto de cromosomas haploide de cada organismo se llama genoma.
- Dependiendo de los propósitos del análisis, puede ser necesario revelar todo el genoma de un individuo o solo identificar si ciertos genes están presentes.
- El proceso por el cual se determina la secuencia de ADN completa de un genoma se llama secuenciación del genoma completo.
- El proceso de detección de la expresión génica de genes predefinidos utilizando portaobjetos de microscopio con ciertas secuencias de ADN o genes ubicados en posiciones definidas se llama microarray.
- La secuenciación del genoma completo es una técnica basada en secuenciación, mientras que Microarray es una técnica basada en hibridación.
- La secuenciación del genoma completo identifica todas las secuencias en un genoma, mientras que Microarray identifica la presencia de un conjunto predefinido de secuencias.
- La secuenciación del genoma completo es más costosa que la microarray.
- La secuenciación completa del genoma genera una gran cantidad de datos y necesita capacidad de almacenamiento relevante y energía informática. Microarray define la presencia/ausencia de secuencias predefinidas y no requiere una capacidad de almacenamiento significativa y potencia informática.