Diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación de escopeta

¿Qué son la secuenciación del genoma completo y la secuenciación de escopeta??

Estos son métodos utilizados para evaluar y secuencias de ADN del genoma de un organismo en un solo momento.

Semejanza

Las similitudes entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación de escopeta incluyen;

• Ambos están involucrados en la secuenciación de fragmentos de ácido desoxirribonucleico
• Ambas técnicas involucran fragmentación genómica
• Ambas técnicas utilizan la digitalización y están basadas en la computadora
• Ambas técnicas juegan un papel fundamental en los estudios de investigación y en el diagnóstico molecular

Secuenciación del genoma completo

La secuenciación de genoma completo, también conocido como (WGS) es una técnica detallada para investigar toda la secuencia genómica de ácido desoxirribonucleico de una célula en un solo momento.

La secuenciación de genoma completo estuvo disponible después de publicar el proyecto del genoma humano, que proporcionó la referencia para las secuencias del genoma humano.

Secuenciación de escopeta

La secuenciación de la escopeta implica la división no planificada de ácido desoxirribonucleico rompiendo secuencias de ácido desoxirribonucleico en muchos fragmentos pequeños y luego ensamblándolas nuevamente (la secuencia) descubriendo las regiones de la superposición.

Diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la escopeta

Descripción

Secuenciación del genoma completo

La secuenciación completa del genoma (WGS) es un proceso de disposición de un solo paso. En esta técnica, primero se produce primero todo el genoma (conjunto haploide de cromosomas en un microorganismo). Después de esto, cada uno de estos pequeños fragmentos quebradizos sufre el proceso de disposición al azar. Una vez que se completa este acuerdo o secuenciación, el análisis tiene lugar. Existe la eliminación del proceso de secuenciación superpuesto en el momento de la evaluación de la disposición/secuencias, y la evaluación no es una técnica ordenada. Por lo tanto, el ensamblaje de las secuencias es un proceso menos exitoso y eficaz. Sin embargo, el proceso de secuenciación del genoma completo es más rápido, y la evaluación de todo el genoma (conjunto haploide de cromosomas en un microorganismo) puede tener lugar en un solo caso.

Secuenciación de escopeta

La secuenciación de escopeta es un método de laboratorio para evaluar la secuencia de ácido desoxirribonucleico del material genético de un organismo (genoma). La técnica incluye romper el material genético del organismo en pequeños fragmentos de ácido desoxirribonucleico que representan la secuenciación individual.

Usos

Secuenciación del genoma completo

• Enfermedad recién nacida y pediátrica: deduce variantes estructurales y escaneos áreas exónicas que no se capturan adecuadamente.
• Ensayos de drogas y farmacogenómica: WGS ofrece un mecanismo front -end beneficioso para los ensayos clínicos, que ayudan a clasificar a las personas (pacientes) sobre la base de su respuesta al medicamento o el medicamento en estudio en estudio.
• Variación regulatoria y EQTLS
• Tipos de rumores raros: WGS es el método correcto para investigar tumores raros. La técnica ayuda a estudiar y capturar el rango completo de mutaciones, desde cambios de base única (una base única en el ácido desoxirribonucleico difiere de la base habitual en esa posición) hasta reordenamientos cromosómicos más grandes, en un experimento único.
• Genómica del clan: pedigríes de enfermedades familiares - Taps Pedigrees multiplex de familias afectadas por problemas genéticos.
• Grandes cohortes con fenotipado extenso

Secuenciación de escopeta

• Investiga la secuencia de ácido desoxirribonucleico del genoma de un organismo.
• Método eficiente para secuenciar indirectamente el ácido ribonucleico o las proteínas (a través de sus marcos de lectura abiertos)
• El método más preferido para todos los demás tipos de conjuntos de cromosomas haploides en una secuenciación de microorganismo también. El conjunto haploide total de cromosomas de muchos organismos: la vaca, el pollo, la rata, la planta de Arabidopsis thaliana, el pez glopio y muchos organismos microscópicos se han secuenciado después de esta técnica.
• Conjuntos de Novo de genomas microbianos casi finales y casi finales en muy menos días
• El poder de secuencia de genomas grandes y complejos
• Gs flx+ longitudes de lectura del sistema de hasta 1 kb
• Realizar ensamblados híbridos

Pasos

Secuenciación del genoma completo

• La generación de secuenciación se lee directamente de un repositorio completo de un repositorio haploide (haploide de cromosomas en un microorganismo)
• Aplicación de métodos computacionales para volver a armar en un solo paso
• Utilizado para la mosca de la fruta (Drosophila melanogaster) y por Celera Genomics (desarrollado 1998) para el genoma humano (conjunto haploide de cromosomas en un microorganismo)

Secuenciación de escopeta

• Los pasos en la secuenciación de escopeta incluyen;
• Preparación de la biblioteca
• Secuenciación de los fragmentos de CFDNA
• Conteo de fragmentos
• Alineación de secuencia
• Análisis estadístico e informes.

Resumen

Los puntos de diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación de escopeta se han resumido como a continuación:

Secuenciación de genoma integral vs secuenciación de escopeta